Klinisk assistent inom Tumörmikromiljö

Beskrivning av arbetsplatsen Lund University Diabetes Centre (LUDC; www.ludc.med.lu.se) utlyser härmed en tjänst som bioinformatiker. LUDC är ett av världens största diabetescentrum med cirka 300 anställda (forskare och övrig personal) som arbetar för att förebygga diabetes samt förbättra diagnostik och behandling av diabetes. För att nå dessa mål arbetar vi vid centret för att kombinera expertis inom genetik, epidemiologi, bioinformatik, molekylär- och cellbiologi, fysiologi och klinisk diabetes och endokrinologi. LUDC har stora unika biobanker och databaser med helgenomsdata länkade till nationella register med data om sjukdomsuppkomst och -förlopp, samt till register med data om behandling och behandlingsrespons. Centret har egna plattformar för de flesta molekylära genetiska metoderna och metabolomik. Arbetsuppgifter och ansvarsområden Den sökande som anställs (bioinformatikern) kommer att ingå i enheten för bioinformatik vid LUDC, som innefattar två bioinformatiker, en biostatistiker, en data manager, en dataingenjör och en IT-data manager (LUDC Bioinformatics Unit | LUDC). Enheten tillhandahåller bioinformatik, biostatistik och computational support till alla som är anslutna till LUDC, samt tillgång till en datormiljö med hög prestanda. Supporten omfattar delaktighet i både långsiktiga forskningsprojekt och mindre omfattande projekt, samt att vara tillgänglig för konsultationer, frågor och vägledning inom ramen för olika LUDC-projekt. Du kommer att hantera förfrågningar och leverera kort- och långsiktiga bioinformatiklösningar till forskare vid LUDC som inte är bioinformatiker och måste kunna kommunicera effektivt med personer som inte är experter på området och planera/fördela sin tid mellan flera olika projekt. Bioinformatikern kommer att bidra till förberedandet av manuskript med state-of-the-art-analyser och bilder/grafer av publikationskvalitet. Bioinformatikern kommer att vara involverad i alla aspekter som ingår för utveckling, implementering och hantering av bioinformatics/computational pipelines för varierande typer av data, inklusive men inte begränsat till genomik, epigenomik, transkriptomik, proteomik, metabolomik, samt kliniska data och metadata. Vi förväntar oss även att bioinformatikern oberoende följer utvecklingen i bioinformatikfältet, för att kunna förbättra befintliga pipelines och presentera alternativa lösningar för hur man bäst använder tillgängliga data och resurser. En annan viktig del av det arbete som bioinformatikern kommer att utföra omfattar kvalitetskontroll, bearbetning och analys av data för Human Tissue Laboratory (HTL), en mycket viktig resurs för LUDC-forskare. HTL samlar in humana vävnadsprover för forskningsändamål och utför centrala analyser av dessa material vilka är tillgängliga för kollegor vid LUDC och Uppsala universitet. Den sökande förväntas även delta i utbildningen av och ge support till LUDC:s personal och forskare vid valet och användningen av bioinformatikverktyg. Kvalifikationer För anställningen krävs:  PhD i bioinformatik, matematik, molekylärbiologi, statistik, datavetenskap eller annat närliggande fält. bevisad erfarenhet av att tillämpa kvantitativa metoder på dataanalysuppgifter, samt erfarenhet av programmering och computing cluster. praktisk erfarenhet av att hantera, analysera och annotera olika typer av omikdata från högkapacitetstekniker, såsom single-cell-, bulk- och spatial RNA-sekvensering, ChIP-seq, CUT&RUN, DNA-metyleringsanalyser, eQTL-kartläggning och immunrepertoarsekvensering, både i explorativa analyser och i standardiserade analysflöden. färdighet i R och kunskap och erfarenhet från BASH/UNIX. erfarenhet av biostatistik samt maskininlärningsalgoritmer och ramverk (t.ex. scikit-learn, Keras och TensorFlow). erfarenhet av dataanalys och datautvinning för att identifiera trender och producera betydelsefulla datavisualiseringar. Erfarenhet av webbaserade bioinformatikverktyg och offentliga databaser med biologiska data. mycket kapabel att samarbeta i tvärvetenskapliga team, som kan inkludera laboratorieforskare, läkare, epidemiologer, bioinformatiker, statistiker och dataanalytiker. vi kommer även att överväga personliga egenskaper där självmotiverade och flexibla individer, som klarar av att arbeta självständigt på ett väldokumenterat sätt, att hantera flera projekt parallellt och att prioritera och möta deadlines, kommer att prioriteras. dokumenterad muntlig och skriftlig utmärkt färdighet i kommunikation på engelska.  Meriterande för anställningen är: erfarenhet av att arbeta med reproducerbara forskningsverktyg såsom R Markdown/Quarto, Git, Conda, Snakemake eller andra arbetsflödesspråk och containerbaserade lösningar. erfarenhet av artificiell intelligens (AI), maskininlärning och djupinlärning för analys av biologiska och biomedicinska data. GitHub-profil med kodexempel är fördelaktigt. erfarenhet av något annat programmeringsspråk (t.ex. Python, Java, Perl). erfarenhet av att arbeta med multi-omics dataintegration. erfarenhet av analys av metagenomik- och (fosfo)proteomikdata. utmärkta kommunikationsegenskaper (både muntliga och skriftliga), som inkluderar muntliga föredrag och posterpresentationer. erfarenhet av utbildning och/eller undervisning. erfarenhet av att arbeta i en internationell miljö.  Övrigt Anställningen är tillsvidareanställning på 100 %, med tillträde 1 oktober 2026 eller enligt överenskommelse. Provanställning i sex månader kan komma att tillämpas. Så här söker du Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis, publikationslista och uppgifter till 3 referenser. Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan Öppen för alla Vi fokuserar på din kompetens, inte dina övriga förutsättningar. Vi är öppna för att anpassa rollen eller arbetsplatsen efter dina behov.

Gör skillnad. Varje dag. Vill du bidra till diagnostik som har direkt betydelse för patienters vård och behandling? Är du en engagerad biomedicinsk analytiker som vill utvecklas i en verksamhet som präglas av hög kompetens, samarbete och kontinuerlig utveckling? Då kan detta vara tjänsten för dig. Verksamhetsområde (VO) klinisk mikrobiologi, biobank, vårdhygien, arbets- och miljömedicin samt Practicum består av fem verksamhetsgrenar: • Klinisk mikrobiologi Region Skånes laboratorium för mikrobiologisk diagnostik och immunitetsbedömningar vid infektioner orsakade av bakterier, virus, svampar och parasiter. • Biobank omfattar Centrala biobanksenheten med ansvar för Region Skånes biobank samt Regionalt biobankscentrum Syd. • Vårdhygien Skåne Region Skånes expertfunktion för att förebygga vårdrelaterade infektioner och begränsa smittspridning inom vård och omsorg. • Arbets- och miljömedicin Syd expertverksamhet med uppdrag att utreda och förebygga ohälsa kopplad till arbets- och omgivningsmiljö. • Practicum Clinical Skills Centre Region Skånes centrum för klinisk färdighetsträning samt samordning av HLR-verksamheten. Inom verksamhetsområdet arbetar cirka 275 medarbetare med bred specialistkompetens. Tjänsten är placerad vid Klinisk mikrobiologi i Lund, där vi årligen analyserar cirka 1,3 miljoner prover inom ett analyssortiment som omfattar mer än 200 analyser. Verksamheten är ackrediterad enligt ISO 15189 och miljöcertifierad enligt ISO 14001. På enheten Odling och direktpåvisning arbetar cirka 50 medarbetare. Här bedrivs mikrobiologisk diagnostik med fokus på odlingsbaserade analysmetoder för att påvisa och identifiera bakterier, svampar och parasiter. Verksamheten omfattar bland annat odling, artidentifiering, resistensbestämning och mikroskopi samt användning av modern laboratorieteknik såsom masspektrometri och automatiserade odlingssystem. Enheten har en central roll i diagnostiken av infektionssjukdomar och arbetar kontinuerligt med att utveckla metoder och arbetssätt för att säkerställa hög kvalitet och patientsäkerhet. Låter detta som en arbetsplats för dig? Skicka in din ansökan redan idag! 1 plats(er). ARBETSUPPGIFTER Vi söker nu en biomedicinsk analytiker till enheten Odling och direktpåvisning i Lund. Hos oss är arbetet dynamiskt med ständigt nya utmaningar och utvecklingsmöjligheter. På enheten arbetar vi med en kombination av traditionell odlingsmetodik och tekniker såsom masspektrometri, PCR och mikroskopi för att påvisa bakterier, svampar och parasiter i patientprover. Delar av den odlingsbaserade bakteriologin är automatiserad med digital avläsning. Du samarbetar nära med andra yrkesgrupper i tvärprofessionella team som ansvarar för olika delar av diagnostiken. Hos oss utför du samtliga delar av analysprocessen från preanalys av prov till praktiskt utförande av undersökningar samt postanalys. Du förväntas även aktivt delta i verksamhetsutveckling samt i handledning av studenter och läkare. Arbetet kan innebära kvälls- och helgtjänstgöring då verksamheten är bemannad årets alla dagar. KVALIFIKATIONER Vi välkomnar dig som är legitimerad biomedicinsk analytiker med behörighet att verka inom svensk sjukvård. Språkkunskaper i svenska, motsvarande minst nivå C1 enligt Europarådets nivåskala, är ett krav. Det är meriterande om du har erfarenhet av mikrobiologisk diagnostik, gärna med inriktning mot bakteriologi, mykologi eller parasitologi. Praktisk erfarenhet av odlingsbaserade analysmetoder, artidentifiering och resistensbestämning är särskilt värdefull. Även erfarenhet av mykobakteriediagnostik och/eller sepsisdiagnostik är meriterande. Beskriv gärna din erfarenhet inom dessa områden i din ansökan. För att trivas i rollen har du ett analytiskt och kvalitetsmedvetet arbetssätt samt god förmåga att omsätta vetenskapliga principer i det dagliga arbetet. Du är noggrann, strukturerad och ansvarstagande, samtidigt som du är flexibel och har lätt för att anpassa dig till förändrade förutsättningar. Vidare är du en god kommunikatör som bidrar till samarbete, engagemang och delaktighet i arbetsgruppen. Stor vikt läggs vid personlig lämplighet och samarbetsförmåga. Urval sker löpande. Varmt välkommen med din ansökan vi ser fram emot att lära känna dig! Anställningsform: Tillsvidareanställning. Varaktighet:, tillträde: Tillträde enligt överenskommelse. Region Skåne finns till för att alla som bor i Skåne ska må bra och känna framtidstro. Genom gränslösa samarbeten och omtanke skapas de bästa förutsättningar för ett hälsosamt liv inom näringsliv, kollektivtrafik, kultur och hälso- och sjukvård i Skåne. Tillsammans gör vi livet mera möjligt. Medicinsk service är en av Region Skånes tolv hälso- och sjukvårdsförvaltningar, med cirka 2 000 medarbetare. Vi möter vårdens behov av ambulanssjukvård, bild- och laboratorieteknik, klinisk träning och laboratoriemedicin. Den laboratoriemedicinska verksamheten omfattar områdena arbets- och miljömedicin, biobank, genetik, immunologi och transfusionsmedicin, kemi, farmakologi, mikrobiologi samt patologi. Även smittskydd och vårdhygien tillhör förvaltningen. Inom förvaltningen bedriver vi även forskning. På https://www.skane.se/ledigajobb kan du se i vilket skede Region Skånes rekryteringar befinner sig och hur många som har sökt tjänsterna. Om du har skyddade personuppgifter ska du kontakta den kontaktperson som finns angiven i annonsen så att din ansökan blir hanterad enligt särskilda rutiner. När du söker ett jobb hos Region Skåne blir din ansökan en allmän handling enligt offentlighetsprincipen. Uppgifterna behandlas och sparas enligt dataskyddsförordningen (GDPR). Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.