Seksjon for forskning og utprøvende diagnostikk, Helse Stavanger HF

Ved Avdeling for patologi ved Stavanger universitetssjukehus får du muligheten til å bidra i frontlinjen av moderne kreftdiagnostikk og presisjonsmedisin. Gjennom et prosjekt finansiert av Kreftforeningen søker vi en engasjert bioingeniør eller ingeniør som ønsker å arbeide med implementering av både omfattende kreftgenpanelanalyser og ctDNA-baserte analyser for klinisk diagnostikk og forskning. Avdeling for patologi arbeider med diagnostikk og forskning innen kreft og andre sykdommer og er organisert i syv seksjoner. Vi har et sterkt fokus på innovasjon og utvikling av nye diagnostiske metoder som kan gi pasientene bedre og mer persontilpasset behandling. Stavanger universitetssjukehus er en sentral partner i det nasjonale samarbeidet InPreD, som arbeider for å sikre likeverdig tilgang til avansert molekylær kreftdiagnostikk. Samtidig deltar vi i den internasjonale ProBio-studien, der analyser av sirkulerende tumor-DNA (ctDNA) benyttes for å identifisere behandling for pasienter med avansert prostatakreft. Hos oss vil du få en nøkkelrolle i etableringen av fremtidens molekylære diagnostikk og arbeide tett sammen med bioingeniører, molekylærbiologer, patologer, bioinformatikere og klinikere. Se film om Stavanger universitetssjukehus her: https://vimeo.com/1159186100/fe7c710a77?share=copy&fl=sv&fe=ci Attester, vitnemål og eventuell annen relevant dokumentasjon må vedlegges søknaden. ​ Arbeidsoppgaver​ • Preparering av prøvemateriale og utførelse av Next Generation Sequencing (NGS), inkludert bibliotekspreparering både manuelt og ved hjelp av Hamilton-robot. • Kvalitetskontroll av DNA og RNA ved bruk av blant annet Qubit og TapeStation. • Etablering og optimalisering av metoder for analyse av ctDNA fra blodprøver. • Implementering av arbeidsflyter for omfattende kreftgenpaneler basert på vevsprøver. • Etablering, validering og verifisering av nye molekylærpatologiske analyser. • Deltakelse i kvalitetsarbeid, inkludert IVDR-relaterte aktiviteter, avviksbehandling og forbedringsarbeid. • Utarbeidelse av prosedyrer, dokumentasjon, presentasjoner og rapporter. • Samarbeid med andre enheter ved avdelingen og sykehuset, samt med nasjonale og internasjonale samarbeidspartnere og leverandører. Kvalifikasjoner​ • Norsk autorisasjon som bioingeniør, eller annen relevant høyere utdanning innen molekylærbiologi, bioteknologi eller tilsvarende fagområde. • Relevant erfaring med utprøvende kreftdiagnostikk i molekylærpatologisk laboratorium er ønskelig. • Erfaring med NGS, biblioteksoppsett og sekvensering av DNA og RNA er en fordel. • Erfaring med ekstraksjon av DNA og RNA fra blod og/eller formalinfiksert parafininnstøpt vev (FFPE) er ønskelig. • Kjennskap til Illumina-plattformer og tilhørende analysetjenester, som LocalApp og DRAGEN, er en fordel. • Erfaring med prosedyreskriving, valideringsarbeid og effektivisering av prøveflyt er en fordel. • Gode norskkunnskaper er helt avgjørende for forsvarlig pasientbehandling. Søkere som har annet morsmål enn norsk, svensk eller dansk, og som ikke har fullført norskspråklig videregående skole, må minimum ha bestått norsktest på B2 nivå. Dokumentasjon må vedlegges søknaden. Ved ansettelse av allerede fast ansatt i foretaket kan en unntaksvis, i særlige tilfeller, fravike kravet om bestått norsktest på B2-nivå Personlige egenskaper​ • Du arbeider strukturert, nøyaktig og selvstendig. • Du er initiativrik, resultatorientert og løsningsorientert. • Du trives med utviklingsarbeid i et tverrfaglig miljø. • Du kommuniserer godt og bidrar positivt til et faglig og kollegialt godt arbeidsmiljø. • Du ser hva som må gjøres og tilbyr og mottar gjerne hjelp. Vi tilbyr​ • En unik mulighet til å være med på å bygge opp fremtidens kreftdiagnostikk ved Stavanger universitetssjukehus. • Arbeid i skjæringspunktet mellom diagnostikk, forskning og presisjonsmedisin. • Deltakelse i nasjonale og internasjonale samarbeidsprosjekter innen kreftgenomikk og ctDNA-diagnostikk. • Et sterkt fagmiljø med kompetanse innen molekylær patologi og kreftforskning. • Trivelig arbeidsmiljø og lønn i samsvar med gjeldende overenskomst. • Gode pensjons- og forsikringsordninger. • Hjem-jobb-Hjem-avtale med rabatt på 30-dagersbillett og gratis bruk av bysykkel. Vi oppfordrer alle søkere til å benytte Vitnemålsportalen for å laste opp verifiserte vitnemål og karakterutskrifter, der det er mulig. Har du utdanning fra utlandet, legg ved godkjenning fra Direktoratet for høyere utdanning og kompetanse. Mangfoldserklæring​ ​Foretaksgruppen i Helse Vest ønsker å gjenspeile mangfoldet i befolkningen i vår rekruttering. Vi oppfordrer alle som er kvalifiserte til å søke ledige stillinger uansett kjønn, alder, funksjonsevne og flerkulturell bakgrunn. Det samme gjelder dersom man har hatt et lengre opphold fra arbeidslivet. Foretaksgruppen Helse Vest ønsker å legge til rette for et inkluderende rekruttering. Kontaktinformasjon​Emilius Janssen, Seksjonsleder, 95890963 Arbeidssted​Sykehusveien 80 4021 Stavanger Nøkkelinformasjon:​Arbeidsgiver: Helse Stavanger HF Referansenr.: 5194117788 Stillingsprosent: 100% Engasjement Startdato: 04.01.2027 Sluttdato: 31.12.2029 Søknadsfrist: 01.11.2026

Avdeling for patologi arbeider med diagnostikk og forskning av kreft og andre sykdommer. Avdelingen er delt inn i sju seksjoner: Histologi, cytologi, kvantitativ molekylær patologi, seksjon for leger, obduksjon, merkantilt og seksjon for forskning og utprøvende diagnostikk. Det er et nasjonalt mål i Norge at kreftpasienter uten nytte av standardbehandling, skal vurderes for deltakelse i kliniske studier. For å støtte dette skal pasienter tilbys omfattende molekylærgenetiske analyser for å identifisere målrettet behandling og studie muligheter. I 2020 ble InPreD etablert for å sikre lik tilgang til avansert kreft diagnostikk nasjonalt. Stavanger universitetssjukehus (SUS) bidrar med regionale diagnostiske tjenester og kompetanse. Videre utvikling av InPreD fokuserer på kompetansebygging og økt kapasitet. SUS har imidlertid ennå ikke fullt implementert bruk av store genpanel analyser i rutine diagnostikk, blant annet på grunn av begrenset tilgang på spesialkompetanse innen molekylær diagnostikk og bioinformatikk. Gjennom et prosjekt, finansiert av kreftforeningen, har vi nå mulighet for å ansette en bioinformatikker som vil ha ansvar for å implementere bruk av et stort genpanel (f. eks. TSO500v2) innenfor kreft diagnostikk ved avdeling for patologi. Attester, vitnemål og eventuell annen relevant dokumentasjon må vedlegges søknaden. ​ Arbeidsoppgaver​ • Etablere nødvendig infrastruktur og validerte arbeidsflyter for store genpanel analyser ved Stavanger universitetssjukehus • Etablere analyseplattformen for store NGS-baserte genpaneler. • Utvikle og validere bioinformatiske analysepipelines. • Sikre at analysene kan brukes i rutinediagnostikk ved sykehuset • Ansvarlig for god kontakt og samarbeid med Helse Vest IKT • Implementere verktøy som GATK, BWA, SAMtools, FastQC, Nextflow eller Snakemake. • Arbeide med Linux-miljøer, Docker/Singularity og versjonskontroll (Git).  • Behandle og kvalitetskontrollere NGS-data fra kreftpasienter. • Identifisere mutasjoner, kopitallsendringer, fusjoner og andre klinisk relevante genomiske funn. • Bidra til klinisk tolkning av resultatene sammen med patologer og molekylærbiologer. • Bygge lokal kompetanse innen genomisk diagnostikk og bioinformatikk. • Samarbeide med ansatte ved molekylærpatologien for å innføre nye analyser og arbeidsmetoder.  • Gjøre det mulig å identifisere pasienter som kan inkluderes i presisjonsmedisinske studier. • Bidra til InPreD-samarbeidet og nasjonale forskningsprosjekter. • Øke rekruttering av pasienter til kliniske studier gjennom bedre molekylær diagnostikk. • Generere og analysere genomiske data til forskningsprosjekter. • Samarbeide med forskere innen kreftgenomikk og presisjonsmedisin. • Potensielt bidra til vitenskapelige publikasjoner og metodeutvikling Kvalifikasjoner​ • Master eller doktorgrad innen molekylærbiologi eller bioinformatikk. Master/dr. grad innen tilsvarende felter kan vurderes • Erfaring med verktøy og pipelines for handtering og analyse av NGS-data (t.d. GATK, FastQC, BWA, SAM tools) er nødvendig. • Erfaring med programmeringsspråk (Python, R, C++, bash), teknologier (t.d. kubernetes, git, Docker/Singularity Containers), metodologier (t.d. gitops, devops, tdd) og/eller oppsett og drift av linuxbaserte OS • Erfaring innen genomikk drevene basale eller kliniske kreft studier anses som en fordel. • Kjennskap til Workflow Management Systems som Nextflow eller Snakemake er en fordel • Kjennskap til/erfaring med Illumina NGS-instrumenter og tilhørende analysetjenester (LocalApp, Dragen) og/eller TSO500-panelet er en fordel • Kjennskap til skybaserte tjenester analyse (cloud computing/analysis) eller høyytelsesberegninger (HPC) er en fordel • Erfaring eller kjennskap til arbeid i sykehusmiljø eller kliniske laboratorier vil være en fordel • Vi setter pris på deg som ta selv initiativ • Beherske norsk muntlig og skriftlig. Søkere som har annet morsmål enn norsk, svensk eller dansk, og som ikke har fullført norskspråklig videregående skole, må minimum ha bestått Bergenstesten, eller annen norsk test på B2 nivå. Dokumentasjon må vedlegges søknaden. Ved ansettelse av allerede fast ansatt i foretaket kan en unntaksvis, i særlige tilfeller, fravike kravet om bestått norsktest på B2-nivå. Personlige egenskaper​ • Vi søker en person som er resultatorientert, strukturert og har evne til å jobbe selvstendig. • I tillegg til å være arbeidsom stilles det høye krav til nøyaktighet. • Du bidrar positivt til et faglig og kollegialt godt miljø • Du er god til å se hva som må gjøres, og tilbyr og mottar gjerne hjelp. • Det er også ønskelig at kandidaten jobber ryddig, er pliktoppfyllende og har god kommunikasjonsevne. Vi tilbyr​ • Trivelig arbeidsmiljø • Lønn i samsvar med gjeldende overenskomst • Hjem-jobb-Hjem-avtale (god rabatt på 30 dagers billett samt gratis bruk av bysykkel) • Gode pensjons- og forsikringsordninger • Gode velferdsordninger Vi oppfordrer alle søkere til å benytte Vitnemålsportalen for å laste opp verifiserte vitnemål og karakterutskrifter, der det er mulig. Har du utdanning fra utlandet, legg ved godkjenning fra Direktoratet for høyere utdanning og kompetanse. Mangfoldserklæring​ ​Foretaksgruppen i Helse Vest ønsker å gjenspeile mangfoldet i befolkningen i vår rekruttering. Vi oppfordrer alle som er kvalifiserte til å søke ledige stillinger uansett kjønn, alder, funksjonsevne og flerkulturell bakgrunn. Det samme gjelder dersom man har hatt et lengre opphold fra arbeidslivet. Foretaksgruppen Helse Vest ønsker å legge til rette for et inkluderende rekruttering. Kontaktinformasjon​Emilius Janssen, Seksjonsleder, 95890963 Arbeidssted​Sykehusveien 80 4021 Stavanger Nøkkelinformasjon:​Arbeidsgiver: Helse Stavanger HF Referansenr.: 5194067653 Stillingsprosent: 100% Engasjement Startdato: 01.12.2026 Sluttdato: 31.05.2028 Søknadsfrist: 27.10.2026