Postdoktor inom strukturell bioinformatik och evolution av bakteriofagproteiner

Beskrivning av arbetsplatsen Som postdoktor blir du en del av forskargruppen Proteinevolution, som leds av Gemma C. Atkinson vid

Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap, Lunds universitet. Vi använder jämförande genomik, känsliga metoder för att

förutsäga proteinfunktion och strukturell bioinformatik för att undersöka hur mikrobiella konflikter utvecklas och fungerar på

molekylär nivå, särskilt samspelet mellan bakterier och bakteriofager. Vår beräkningsinriktade forskning är nära integrerad med

experimentellt arbete genom samarbeten inom mikrobiologi, biokemi och strukturbiologi. Projektbeskrivning Bakteriofager kodar för

många proteiner vars funktioner och interaktionspartner ännu är okända. I projektet kombinerar du proteinstruktur- och

komplexprediktion med jämförande genomik och evolutionsanalyser för att undersöka interaktioner mellan bakteriofagproteiner och

mellan fagproteiner och deras bakteriella värdar. Målet är att upptäcka tidigare okända molekylära interaktioner och förstå hur

proteiners evolution påverkar deras funktion i fagbiologi och virus–värdinteraktioner. De beräkningsbaserade förutsägelserna ger

upphov till hypoteser som kan undersökas experimentellt tillsammans med våra samarbetspartner. Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Du kommer att bedriva beräkningsinriktad forskning med Python-programmering och storskalig prediktion av proteinstrukturer med

hjälp av högpresterande beräkningsresurser. Du kommer att arbeta nära andra medlemmar i forskargruppen och externa

samarbetspartner. Anställningen ger dig möjlighet att utveckla din självständighet som forskare och bredda din vetenskapliga

kompetens. Det kan även finnas möjlighet att medverka i undervisning och få erfarenhet av handledning av masterstudenter.

Kvalifikationer Krav för anställningen är: - Du har doktorsexamen eller motsvarande utländsk examen inom bioinformatik,

molekylärbiologi, mikrobiologi eller ett närliggande ämne. Doktorsexamen ska vara avlagd senast vid tidpunkten då

anställningsbeslut fattas. - Du har god förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet. - Du har goda

programmeringskunskaper. - Du har ingående kunskaper om bakteriofagers molekylärbiologi. - Du har omfattande erfarenhet av

prediktion av proteinstrukturer och av att använda sådana prediktioner i biologisk forskning. - Du har publicerat forskning om

bakteriofager i välrenommerade vetenskapliga tidskrifter. Meriterande för anställningen är: - Främst kommer den sökande i fråga

som avlagt examen högst tre år före sista ansökningsdag. - Du har erfarenhet av att förutsäga funktioner hos proteiner med okänd

funktion genom att integrera information om sekvens, struktur och genomisk kontext. - Du har erfarenhet av tvärvetenskapliga

forskningssamarbeten. - Du har utvecklat bioinformatiska verktyg med öppen källkod. - Du har god pedagogisk förmåga. Bedömningen

av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare. Särskild vikt kommer att

fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet. Vi erbjuder Vi erbjuder en tvärvetenskaplig forskningsmiljö där bioinformatik,

mikrobiologi, biokemi och strukturbiologi möts för att undersöka proteiners funktion och evolution. Du kommer att samarbeta nära

med forskare inom både beräkningsvetenskap och experimentell forskning och ha tillgång till högpresterande beräkningsresurser.

Anställningen ger dig möjlighet att utveckla egna forskningsidéer, bygga internationella samarbeten och få erfarenhet av

undervisning och handledning. Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös

semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss. Om

anställningen Anställningen är en visstidsanställning på två år, 100% med startdatum 2027-02-01 eller enligt överenskommelse.

Anställningar vid Lunds universitet bedrivs i Sverige och du kommer att vara placerad vid Biomedicinskt centrum (BMC) i Lund och

förväntas utföra ditt arbete på plats. Anställningen är tidsbegränsad till minst två år, max tre år enligt kollektivavtal om

tidsbegränsad anställning som postdoktor (Arbetsgivarverket). En anställning som postdoktor är tänkt som ett inledande steg i

karriären och som en möjlighet att ytterligare fördjupa och bredda forskningskompetens. Så här söker du Anställningen söks via

universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver varför du är intresserad av

anställningen och hur den motsvarar dina meriter. Bifoga även examensbevis och ett CV med publikationslista, länkar till

exempelvis kod på GitHub samt kontaktuppgifter till två referenspersoner. Mer information om Medicinska fakulteten