Senior bioinformatiker till GMCK

Vill du arbeta i absolut framkant av den molekylära precisionsdiagnostiken? Vi söker bioinformatiker för att stärka den pågående

implementeringen av storskalig DNA-sekvensering inom sjukvården. Du erbjuds - En spännande multidisciplinär arbetsmiljö där ditt

dagliga arbete gör stor skillnad för ett stort antal patienter - Stor möjlighet att utvecklas i din roll och ta dig an nya

arbetsuppgifter över tid - Möjligheten att arbeta på ett av världens bästa sjukhus med vård i framkant (World's Best Hospitals

2026 - Newsweek Rankings). Självklart får du också ta del av våra generella förmåner som Karolinska Universitetssjukhuset erbjuder

dig.

Om tjänsten

Tjänsten är placerad vid Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), som är en del av Medicinsk diagnostik

Karolinska (MDK). GMCK ansvarar för att tillhandahålla storskaliga och avancerade genomikanalyser till samtliga

laboratoriemedicinska specialiteter inom MDK. Vårt uppdrag är att möjliggöra precisionsdiagnostik genom högkvalitativa genetiska

analyser med fokus på klinisk relevans och teknisk spetskompetens. Du bidrar till arbetet i ett multidisciplinärt team tillsammans

med läkare, molekylärbiologer, andra bioinformatiker och mjukvaruutvecklare inom sjukhuset samt med forskningsinfrastrukturen

Clinical Genomics vid Science for Life laboratoriet (SciLifeLab) och forskargrupper på Karolinska Institutet. I rollen kommer du

bland annat att: - bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av våra bioinformatiska NGS flöden - analysera

patientprover inom interna och externa forskningsprojekt och kliniska implementationsprojekt. - bidra med expertis inom dataanalys

i bioinformatiska utvecklingsprojekt. - bistå vår våtlabbsenhet med expertis inom dataanalys vid implementering av nya tekniker

och metoder. - delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde. - delta i tvärvetenskapliga möten

och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS).

Vi söker dig som

• är noggrann, strukturerad och har hög

ansvarskänsla för kliniska leveranser. - har en stark analytisk förmåga och nyfikenhet på nya tekniker inom genomik. - har en god

kommunikativ förmåga och trivs i gränssnittet mellan bioinformatik och medicinsk diagnostik. - har ett engagemang för kvalitet och

trivs med att samverka i grupp.

Kvalifikationer

Krav:

• Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik,

biomedicin eller annat relevant område. - Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplat till storskalig

DNA/RNA-sekvensering (NGS). - Goda programmeringskunskaper (t.ex. Python, R) - Vana att arbeta i Linuxmiljö - Erfarenhet av arbete

i HPC-miljö, gärna med SLURM - Goda kunskaper inom statistik, analys och testdesign - Mycket god förmåga att uttrycka dig på

engelska, både muntligt och skriftligt Meriterande:

• Doktorsexamen (PhD) inom relevant område. - Erfarenhet av arbete i klinisk

sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, eller inom annan ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189). - Erfarenhet av

containerteknologier (t.ex. Singularity, Docker) - Erfarenhet av automatiserad testning, CI och strukturerad kod - Kunskap i

versionshantering (Git) - Erfarenhet inom utveckling av bioinformatiska analyser med Nextflow eller liknande ramverk för

automatisering av beräkningsanalyser - Erfarenhet av utveckling och arbete i kvalitetssäkrade miljöer - God förståelse för human

genomik kopplat till sällsynta diagnoser eller somatiska sjukdomar - Fördjupade kunskaper inom design och validering av breda

genetiska paneler. - Goda kunskaper i svenska i tal och skrift. Om rekryteringsprocessen Urval och intervjuer kan komma att ske

löpande under ansökningstiden. I samband med din ansökan behöver du bifoga CV. Istället för ett personligt brev ber vi dig besvara

urvalsfrågor samt kort motivera varför du passar för rollen. Att besvara frågorna är en förutsättning för att din ansökan ska

anses komplett. Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska!