Om tjänsten
Vill du bedriva banbrytande forskning i en framstående miljö inom evolutionsbiologi vid Sveriges största fakultet för
naturvetenskap och teknik? Institutionen för ekologi och genetik vid Uppsala universitet bedriver världsledande forskning inom
biologi, från molekyler till ekosystem och globala biodiversitetsmönster. Vi söker nu en doktorand som vill utveckla sin
forskarkarriär tillsammans med oss. Institutionen för ekologi och genetik (IEG) vid Evolutionsbiologiskt centrum (EBC) är en
internationell miljö där våra medarbetare bedriver forskning för att förstå ekologiska och evolutionära processer på alla nivåer
av biologisk organisation. IEG erbjuder tillgång till avancerade nationella och lokala forskningsinfrastrukturer, inklusive
superdatorresurser (NAISS) och de senaste molekylära teknologierna och sekvenseringsplattformarna (SciLifeLab-plattformar). IEG
har ett klimatlaboratorium med kontrollerade miljökammare och växthus, ett toppmodernt molekylärt laboratorium, samt anläggningar
för djuruppfödning. Doktorander vid IEG kan ansluta sig till forskarskolan, som erbjuder goda möjligheter till nätverkande både på
och utanför campus med doktorander från de två andra biologiska institutionerna vid Uppsala universitet (Institutionen för
organismbiologi och Institutionen för cell- och molekylärbiologi). Tjänsten erbjuds inom forskningsprogrammet för Zooekologi vid
IEG. Programmets nuvarande forskning omfattar populations- och bevarande-genomik och kvantitativ genetik, evolutionär ekologi,
beteendeekologi, och makroekologi. Ytterligare information om programmet för djurekologi finns här. Projektbeskrivning En central
fråga inom evolutionsbiologi är om evolutionära förändringar är upprepbara och om samma gener bidrar till upprepade fenotypiska
anpassningar. Denna fråga har viktiga implikationer för vår förmåga att kunna förutsäga genetiska responser på förändrade miljöer.
Detta projekt ämnar integrera mekanistiska insikter om fenotypisk anpassning med genomiska data för att förstå hur arter utvecklar
anpassningar till förändringar i sin livsmiljö. Projektet kommer att utnyttja data från ett storskaligt
Evolve-and-Resequence-experiment på en utbredd skadeinsekt, fröbaggen Callosobruchus maculatus. Detta unika system möjliggör
studier av determinismens och slumpens roll för lokal anpassning och evolutionen av en arts ekologiska nisch. Fenotypiska data,
RNA-seq och DNA pool-seq-data finns tillgängliga från flera tidpunkter i experimentet, som fortfarande pågår. Berger-gruppen
upprätthåller även flera andra geografiska populationer av C. maculatus samt närbesläktade arter av fröbaggar. Detta ger
möjligheter till komparativ genomik samt ytterligare experiment och datainsamling. Arbetsuppgifter Doktorandprojektet kommer att
innefatta en kombination av experimentellt laboratoriearbete samt bioinformatisk analys, med tyngdpunkt på det senare. Den exakta
fördelningen mellan arbetsuppgifterna kan bero på kandidatens intressen och projektets utveckling. Doktorander vid Institutionen
för ekologi och genetik (IEG) har möjlighet att delta i undervisning och att utveckla sitt pedagogiska CV genom att gå kurser. Typ
och omfattning av undervisningen beror på tillgång och studentens intressen men får inte överstiga 20% av heltid. Anställning och
finansiering förlängs motsvarande den tid som läggs på undervisning. Doktoranden kommer att arbeta tillsammans med
huvudhandledaren David Berger och biträdande handledaren, SciLifeLab-forskaren Dr Gabriela Montejo-Kovacevich, båda verksamma vid
IEG. Kvalifikationskrav För att uppfylla behörighetskraven för doktorandstudier måste du: - ha en magisterexamen (andra cykeln) i
evolutionsbiologi, ekologi, bioinformatik eller ett relaterat område, eller - ha avslutat minst 240 högskolepoäng, varav minst 60
poäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt projekt värt minst 15 poäng, eller - ha förvärvat motsvarande kunskaper på
annat sätt (t.ex. omfattande forskningserfarenhet). Kandidater som ej ännu tagit ut sin examen men förväntas uppfylla kraven vid
tillträdesdatum kan söka tjänsten. Den ideala kandidaten bör även: - Ha god förståelse för centrala begrepp inom ekologi och/eller
evolutionsbiologi/genetik. - Ha erfarenhet av programmering. - Vara motiverad och nyfiken samt trivas i en samarbetsinriktad
miljö. - Kunna ta ansvar för att genomföra och slutföra självständiga uppgifter och projekt. - Kunna uttrycka sig väl i både talad
och skriven engelska. Meriterande Erfarenhet av statistiska analyser tillämpade på kvantitativ genetisk eller populationsgenomisk
data. Erfarenhet av arbete med bioinformatiska pipelines på servrar och kluster. Experimentellt arbete, såsom erfarenhet av
experimentell evolution eller arbete med genetiska linjer. Om anställningen Anställningen är en tidsbegränsad tjänst enligt
högskoleförordningen kapitel 5 §7. Omfattning: heltid (100%), i fyra år. Tillträdesdatum: 2027; flexibelt enligt överenskommelse.
Placering: Uppsala Universitet. Regler för doktorander framgår av högskoleförordningen kapitel 5, §§ 1–7 samt av Uppsala
universitetets regler och riktlinjer. Instruktioner för ansökan Ansökan ska innehålla: - Ett personligt brev där du beskriver dig
själv, dina forskningsintressen, varför du vill doktorera, samt varför du är lämplig för just denna tjänst och projekt (max 2
sidor) - CV - Kort beskrivning av din utbildning, - Kopia av masterexamen och kursbetyg samt kopia av masteruppsatsen - Namn och
kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (e-post och telefonnummer), - Eventuella publikationer. Upplysningar om
anställningen lämnas av Universitetslektor, David Berger, david.berger@ebc.uu.se Välkommen med din ansökan senast den 1 November,