Bioinformatiker inom cancergenomik till GMCK

Vill du arbeta i absolut framkant av den molekylära precisionsdiagnostiken? Vi söker en bioinformatiker till vårt tolkningsteam

inom cancerområdet. Här får du en nyckelroll där din analys och tolkning direkt påverkar diagnostik och behandlingsbeslut för

cancerpatienter. Du erbjuds - Ett meningsfullt arbete där din insats gör direkt nytta i patientdiagnostiken. - En roll med goda

utvecklingsmöjligheter och att över tid ta ett större ansvar. - Möjlighet att arbeta i ett tvärvetenskapligt team med

flexibla arbetstider och hybridarbete. - Stöd för fortbildning och professionell utveckling i en inkluderande miljö på ett av

världens främsta universitetssjukhus. Självklart får du också ta del av våra generella förmåner som Karolinska

Universitetssjukhuset erbjuder dig.

Om tjänsten

Tjänsten är placerad vid Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), som är en del

av Medicinsk diagnostik Karolinska (MDK). GMCK ansvarar för att tillhandahålla storskaliga och avancerade genomikanalyser till

samtliga laboratoriemedicinska specialiteter inom MDK. Vårt uppdrag är att möjliggöra precisionsdiagnostik genom högkvalitativa

genetiska analyser med fokus på klinisk relevans och teknisk spetskompetens. I den här rollen blir du en del av vårt tolkningsteam

inom solida tumörer. Huvudfokus ligger på att tolka bioinformatiska resultat från storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS) utifrån

etablerade standardrutiner (SOP:er). Du sammanställer och kvalitetssäkrar underlagen som sedan lämnas över till patolog för

slutgiltig medicinsk bedömning. För rätt person finns det goda möjligheter att på sikt få ett utökat ansvar, samt bidra till

vidareutvecklingen av våra tolkningsflöden och rutiner. I rollen kommer du bland annat att: - tolka genetiska varianter (SNV, CNV,

fusioner m.fl.). - samarbeta nära och diskutera resultat med patologer, molekylärbiologer och kliniker. - bidra till kontinuerlig

förbättring, validering och utveckling av tolkningsflödena. - delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande

arbetsflöde. - delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS). Vi söker dig som -

är noggrann, strukturerad och har hög ansvarskänsla för kliniska leveranser. - har en god kommunikativ förmåga och trivs i

gränssnittet mellan bioinformatik och medicinsk diagnostik. - har ett engagemang för kvalitet och trivs med att samverka i grupp.

Kvalifikationer

Krav:

• Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant

område. - Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS). - Erfarenhet av

arbete eller forskning inom cancergenomik och/eller cancerbiologi. - Mycket goda kunskaper i svenska och engelska, i både tal och

skrift (svenska krävs för den dagliga kommunikationen med övrig vårdpersonal). Meriterande:

• Doktorsexamen (PhD) inom relevant

område. - Praktisk erfarenhet av varianttolkning och/eller annotering av somatiska varianter inom cancergenomik. - Erfarenhet av

arbete som sjukhusgenetiker eller biträdande sjukhusgenetiker (eller motsvarande klinisk roll). - Erfarenhet av arbete i klinisk

sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, eller inom ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189). - Erfarenhet av, eller intresse

för operativ samordning eller projektledning. - Kunskap om klassificeringssystem för somatiska varianter (t.ex. AMP-riktlinjer). -

God programmeringsförmåga (t.ex. Python) och vana av Linux-miljöer/HPC. Om rekryteringsprocessen Urval och intervjuer kan komma

att ske löpande under ansökningstiden. I samband med din ansökan behöver du bifoga CV. Istället för ett personligt brev ber vi dig

besvara urvalsfrågor samt kort motivera varför du passar för rollen. Att besvara frågorna är en förutsättning för att din ansökan

ska anses komplett. Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska!